5甲基胞嘧啶 (5-methylcytosine, 5mC) 是一种常见的DNA修饰类型，能调节基因表达、转座子及染色体的状态等。全基因组重亚硫酸盐转化的WGBS法，能够实现单碱基分辨率的甲基化位点准确、高效定位。通过***分析不同处理方式下的全基因组甲基化水平，快速准确鉴定出差异甲基化区域，有助于我们更加***深入地了解动、植物的甲基化模式和表观调控机制，在动物行为、植物胁迫、植物性状、胚胎发育、cancer疾病、生物标记物等方面具有普遍的应用。在基因组的某些区域中，通常位于基因的启动子区，CpG 序列密度很高，可以达均值的5 倍以上。北京甲基化重测序机构
DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶的作用下，使胞嘧啶的5位碳原子发生甲基化的生物化学过程。DNA胞嘧啶甲基化是一种稳定的表观遗传学标记，在调控特定基因表达、转座子沉默、基因印记、X染色体失活以及基因组稳定性等多种生物学过程中发挥着重要作用。在动物中，DNA甲基化主要发生在CpG二核苷酸的背景下，约为70-80%的DNA甲基化。然而，剩余未发生甲基化的CpG位点则主要密集分布于基因的启动子区域和the first exon region，被称为CpG岛(CpG island)，在基因表达的调控和基因突变上都可能发挥着重要作用。成都bisulfite甲基化重测序准确度高以MethlyC-seq为例，将DNA段化后收集特定长度的片段并修复DNA末端.
亚硫酸氢钠修饰后测序法是一种对DNA进行亚硫酸氢钠处理、聚合酶链反应扩增与DNA测序相结合的方法，能够提供测定区域的序列信息，准确定位甲基化胞嘧啶位点；重亚硫酸盐修饰后，甲基化胞嘧啶保持不变，但非甲基化胞嘧啶转变为尿嘧啶，PCR扩增后为胸腺嘧啶，其将甲基化状态的差异转化成碱基的差异，从而对胞嘧啶的甲基化状态进行分析；但在亚硫酸钠处理的酸性环境下，单链特异性PCR模板稳定性下降，容易降解；并且模板链CG二核苷酸水平高易形成复杂的二级结构，常出现非特异性条带，结合“巢式PCR法”能明显提高扩增的特异度。
DNA甲基化是研究 为普遍的表观遗传修饰，它被认为在许多生物学过程和疾病中有着重要的作用。随着测序技术的快速发展，二代测序与重亚硫酸盐处理基因组DNA相结合产生了可以在全基因组单碱基水平上测量DNA甲基化水平的全基因组重亚硫酸盐测序（whole-genome bisulfite sequencing，WGBS）技术。WGBS的流程与全基因组DNA测序主要区别于DNA文库的构建。以MethlyC-seq为例，将DNA 段化后收集特定长度的片段并修复DNA末端，再将双端加上3′-dAMP然后连接上甲基化的接头，接着用重亚硫酸盐处理DNA使未甲基化的胞嘧啶（C）转化为尿嘧啶（U）， 终进行低循环数的PCR扩增后完成建库，建库完后上机测序，得到原始数据（fastq文件）后，完成一定的质量控制后就可以进行mapping分析。DNA甲基化可引起基因组中相应区域染色质结构变化,使DNA失去核酶限制性内切酶的切割位点,。
DNA（主要是CpG的）甲基化是其遗传机制和表型效应**为明确的表观遗传性机制。DNA甲基化谱式的变化不仅指导在正常发育过程中细胞谱系特化所依据的基因组转录谱式的改变，且在疾病发生和发展的基因表达异化中起着决定性的作用。为了高效准确的分析基因组中所有的甲基化位点，可采用全基因组甲基化（Whole Genome Bisulfite Sequence，WGBS）。亚硫酸氢盐处理是一种分类5-甲基胞嘧啶和非甲基化碱基的有效方法之一，包括基于序列、熔化温度和交互的分析，WGBS是通过重亚硫酸氢盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶（C）脱氨基转变为尿嘧啶（U），而甲基化的胞嘧啶保持不变，再经PCR将U转变为T，结合NGS便可高效准确地分析基因组中所有甲基化位点。WGBS（Whole Genome Bisulfite Sequence）全基因组甲基化测序.河南目标区间甲基化重测序机构
重亚硫酸盐测序本质上就是重亚硫酸盐转化与二代测序（NGS）的结合。北京甲基化重测序机构
DNA甲基化（DNA methylation）为DNA化学修饰的一种形式，能够在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下，在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团。大量研究表明，DNA甲基化能引起染结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变，从而控制基因表达。WGBS是基于重亚硫酸盐的甲基化分析方法，首先通过Bisulfite对样本DNA进行处理，将未甲基化的C碱基转化为U碱基，而甲基化的C碱基则不会改变，进行PCA扩增后U碱基会变成T，与原本甲基化的C碱基区分开，再结合高通量测序技术，可绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。北京甲基化重测序机构
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