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高通量二代测序法SNP基因分型——你有我有,你没有我也有:上海翼和应用生物技术有限公司通过自主研发的高重PCR技术,扩增引物经修饰及优化,克服了传统多重PCR扩增效率不均一问题,95%以上扩增子的测序深度在平均测序深度的0.2X范围,保证测序通量的有效利用。基于超高重PCR技术平台的高通量二代SNP分型服务,适用于多种遗传学研究领域,如疾病与基因的关联分析,临床分子诊断研究,QTL定位及分子育种等大规模多位点大样本的SNP分析。SNP分型评估下来好多个有同源区段怎么办?翼和生物多重长片段巢式PCR技术中高通量分型方案解决技术难题。浙江高同源序列SNP分型送样要求

基因的直系同源、旁系同源或异源同源关系[1]。祖先物种通过两次物种分化形成ABC三个物种;伴随物种分化而进行的两次基因重复共形成A1、B1、B2、C1、C2、C3等6个基因。显然,C2与C3互为直系同源;B1与C1互为旁系同源;AB1与其他6个基因互为异源同源。然而,B1和B2、B2和C1又是什么关系呢?在这个问题上曾引起争议。B1和B2、B2和C1的分离是由于***次基因重复而产生的,套用定义,可得出B1和B2、B2和C1互为旁系同源。同理,B1和C2/C3、C1和C2/C3也互为旁系同源。类似的,根据直系同源基因的定义,B2和C2/C3、A1和所有B基因及C基因互为直系同源。安徽高同源分型送样要求在进行基因组研究中经常会遇到各类高同源区段,比如人基因组中P450基因家族,HLA基因座位。

上机测序后,每个样本同一个SNP位置可以读到数十或数百条reads(具体取决于测序通量),并且能够清晰看到每条序列的具体信息,通过对SNP位点的聚类分析,实现位点基因型的判断。大规模样本中二等位基因reads比分布结果,每一个点**一个样本一个SNP位点的聚类结果,两端表示纯和,中间表示杂合(理想情况,1/0表示纯和,0.5表示杂合)。上海翼和应用生物技术有限公司上海翼和**团队富有开创精神,朝气蓬勃,在肖君华博士的带领下,秉承“专业、协作、进取”的企业精神,为科研用户提供性价比高、高质量可靠的遗传学技术服务和产品。微信公众号:上海翼和生物

二代测序法主要通过PCR的方法,对目标SNP位点进行特异性捕获。为了提**型的通量,目前多采用多重PCR的方法同时对多个位点进行捕获(可同时对1-100位点进行分型)。由于二代测序通量是足够满足数百数千样本的同时测序,因此需要对不同的样本添加***的样本标签(Barcode),从而在后续数据分析过程中,能够进行样本拆分。因此在多重PCR完成***轮多SNP位点捕获后,需要进行第二轮PCR,在***轮PCR产物的基础上,添加样本样本标签及测序接头等序列。通过PCR条件优化,目前亦可实现一次反应,两轮PCR接力完成的效果。根据高同源区段位点数量,提供多重长片段巢式PCR-LDR SNP分型和多重长片段巢式PCR-NGS SNP分型两种解决方案。

上海翼和生物根据具体实验规模,提供两种检测平台,分别为:适合中低通量检测的PCR-LDR分型服务和适合高通量的基于二代Hi-SNP分型服务。PCR-LDR SNP分型服务:PCR-LDR技术是PCR技术和LDR(Ligase Detection Reaction,连接酶检测反应)想结合的检测技术。LDR是利用高温连接酶实现对基因多态性位点的识别。高温连接酶一旦检测到DNA与互补的两条寡聚核苷酸接头对应处存在着基因点突变类型的碱基错配,则连接反应就不能进行,反之则可以进行连接反应。Hi-SNP结合多重PCR技术和高通量测序技术,对需要检测的位点设计特异性引物,在单管内进行多重PCR扩增,不同的样本以不同的Barcode引物区分。混合样本后,在illumina 等主流测序平台上,对扩增子进行高通量测序。测序结果使用生物信息学方法,区分不同的样本,,终获得每个位点的SNP信息。高通量测序能一次对几百万条DNA分子进行序列测定,相比其他的SNP检测技术,基于高通量测序的SNP分型具有更准确、更灵敏的特点。SNP在人类基因组中普遍存在,平均每500~1000个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。北京高同源序列分型机构

目前已有多种方法可用于SNP检测,如根据动态等位基因特异的杂交、DNA芯片以及TaqMan系统等。浙江高同源序列SNP分型送样要求

所谓同源序列,简单地说,是指从某一共同祖先经趋异进化而形成的不同序列。必须指出,相似性(similarity)和同源性(homology)是两个完全不同的概念。相似性是指序列比对过程中用来描述检测序列和目标序列之间香通DNA碱基或氨基酸残基顺序所占比例的高低。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位,至今已有十六年历史,专注于为国内科研工作者和生物医药企业提供各类分子遗传学技术服务和质控试剂盒。基于自主知识产权的多重PCR技术,翼和生物研发和改良了适用于荧光定量PCR、一代测序和二代高通量测序平台的多种检测技术和产品,逐步形成了在细胞组织和动物模型质控、大健康检测和科学研究3大板块产品布局。浙江高同源序列SNP分型送样要求

上海翼和应用生物技术有限公司是一家第三方检测服务;生物专业领域内的技术开发、技术咨询、技术服务;健康衰老评估;大健康检测;遗传学技术服务;生物医药行业质控检测技术技术服务;小鼠遗传品系鉴定;转基因小鼠基因型鉴定;细胞点突变检测;细胞端粒长度和端粒酶活性检测。的公司,是一家集研发、设计、生产和销售为一体的专业化公司。翼和生物拥有一支经验丰富、技术创新的专业研发团队,以高度的专注和执着为客户提供细胞组织小鼠质控,大健康检测,生物技术服务。翼和生物继续坚定不移地走高质量发展道路,既要实现基本面稳定增长,又要聚焦关键领域,实现转型再突破。翼和生物始终关注自身,在风云变化的时代,对自身的建设毫不懈怠,高度的专注与执着使翼和生物在行业的从容而自信。

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