TaqMan荧光探针法优点是操作简单，准确性高（闭管进行，减少污染），判读也很方便，认可度高；适合多样本，少位点。但是其也有不可忽视的限制性，如探针合成耗时较长，价格昂贵，为了保证探针的稳定质量，一般大家会选择A公司合成。TaqMan荧光探针法一般为只有几个位点时适用，并且对样本的质量要求较高，除了样本无降解外，要需要浓度尽可能的一致。上海翼和应用生物技术有限公司，地址：上海市松江区龙腾路1015弄中星创意园2号502在精细定位、分子育种过程中遇到高同源区段SNP，并且无法舍弃时，翼和生物提供特色的解决方案，欢迎来撩！山东高同源序列分型
BLAST是一个机遇序列相似性的数据库搜索程序。是“局部相似性基本查询工具”（BasicLocalAlignmentSearchTool）的缩写。Blast是一个序列相似性搜索的程序包，其中包含了很多**的程序，这些程序是根据查询对象和数据库的不同来定义的。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位，是上海市****，至今已有十六年历史，专注于为国内科研工作者和生物医药企业提供各类分子遗传学技术服务（高同源区段SNP分型）和质控试剂盒。浙江高同源区段分型哪里做SNP是人类可遗传的变异中比较常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。
RFLP法的优点是分型技术简单，结果判断容易，不需要昂贵的设备，成本低，并且实验人员培训简单。但是通过SNP能够导致RFLP的概率低，很多SNP位点不能采用这种方法进行检测，而且有的限制性酶价格昂贵并且不容易买到。通常酶切的条件较高，容易出现假阳性结果，且工作量大，耗时长，通量低。这是早期的一种SNP分型技术，在通量和效率上难以满足批量分型需求，因此这种技术目前只在个别实验室中还在使用中。上海翼和应用生物技术有限公司
二代测序法主要通过PCR的方法，对目标SNP位点进行特异性捕获。为了提**型的通量，目前多采用多重PCR的方法同时对多个位点进行捕获（可同时对1-100位点进行分型）。由于二代测序通量是足够满足数百数千样本的同时测序，因此需要对不同的样本添加***的样本标签（Barcode），从而在后续数据分析过程中，能够进行样本拆分。因此在多重PCR完成***轮多SNP位点捕获后，需要进行第二轮PCR，在***轮PCR产物的基础上，添加样本样本标签及测序接头等序列。通过PCR条件优化，目前亦可实现一次反应，两轮PCR接力完成的效果。可以根据以往文献，在所研究疾病的多个候选基因上面选择多个SNP，比如选择DNA修复通路中几个基因的重要SNP.
理论上讲，SNP既可能是二等位多态性，也可能是3个或4个等位多态性，但实际上，后两者非常少见，几乎可以忽略。因此，通常所说的SNP都是二等位多态性的。这种变异可能是转换（C T，在其互补链上则为G A），也可能是颠换（C A，G T，C G，A T）。转换的发生率总是明显高于其它几种变异，具有转换型变异的SNP约占2/3，其它几种变异的发生几率相似。Wang等的研究也证明了这一点。转换的几率之所以高，可能是因为CpG二核苷酸上的胞嘧啶残基是人类基因组中，易发生突变的位点，其中大多数是甲基化的，可自发地脱去氨基而形成胸腺嘧啶。在基因组DNA中，任何碱基均有可能发生变异，因此SNP既有可能在基因序列内，也有可能在基因以外的非编码序列上。总的来说，位于编码区内的SNP（coding SNP,cSNP）比较少，因为在外显子内，其变异率*及周围序列的1/5.但它在遗传性疾病研究中却具有重要意义，因此cSNP的研究更受关注。如何在HSVs和PSVs筛选到等为同源序列变异SNPs，是高同源区段SNP及序列分析所面临的挑战。上海高同源区段SNP分型分析
组成DNA的碱基虽然有4种，但SNP一般只有两种碱基组成。山东高同源序列分型
LDR连接酶检测法优点是适用于任何多态性位点，基于杂交反应和连接反应，分型结果准确，可进行多重反应，性价比较高，且实验灵活。但是相比TaqMan和直接测序法的单一位点检测而言，LDR法可以实现多位点的同时检测，提高检测通量，因此前期需要一定时间构建多重分型方案。因此该方法非常适合相同分型方案，连续样本的分型需求，提高实验通量的同时降低分型单价。上海翼和应用生物技术有限公司总部在上海，2011年无锡成立分公司无锡翼和应用生物技术有限公司山东高同源序列分型
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