pA-MNase(蛋白A-微球菌核酸酶)在以下实验中特别有用:1.**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:这是一种用于研究蛋白质-DNA相互作用的技术,pA-MNase在此技术中用于在免疫沉淀后切割染色质DNA,以分析特定蛋白质与DNA的结合位点。2.**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:这是一种蛋白质-基因组互作研究技术,pA-MNase在此技术中用于在目标蛋白质被抗体识别后,通过核酸酶活性切割附近的DNA,从而释放与目标蛋白质相互作用的DNA片段。CUT&RUN技术相比传统的ChIP-Seq具有实验周期短、信噪比高、可重复性好以及细胞投入量低的优势,尤其适用于早期胚胎发育、干细胞、**以及表观遗传学等研究领域。3.**染色质免疫沉淀实验**:pA-MNase在染色质免疫沉淀实验中用于染色质片段化,它在核小体间DNAlinker上进行切割保持了核小体的完整性,并且由于其温和的酶解条件,消除了超声功率的可变性和超声过程中染色质乳化所带来的负面影响。4.**去除核酸污染**:pA-MNase也可用于去除细胞裂解液中的核酸,以减少样品的粘度,这对于后续的蛋白质分析实验尤为重要。
BsuDNAPolymerase(嗜热脂肪芽孢杆菌DNA聚合酶)在PCR中的应用具有多个优势,以下是一些关键点:1.**链置换活性**:BsuDNAPolymerase具有很强的链置换活性,这使得它非常适合于等温扩增技术,如重组酶聚合酶扩增(RPA)。在这些技术中,BsuDNAPolymerase可以快速、高效、特异性地扩增模板,在10到30分钟内将痕量的核酸模板(低至单拷贝)扩增至可以检出的水平。2.**高温稳定性**:BsuDNAPolymerase在高温下保持活性,这使得它在一些需要高温反应的实验条件下表现出色。3.**高灵敏度和特异性**:BsuDNAPolymerase在等温扩增中展现出高灵敏度,能够将微量核酸模板扩增到可检测水平。同时,它也具有高特异性,减少了非特异性扩增的风险。4.**简化的样品处理**:BsuDNAPolymerase可以直接对复杂样品进行扩增,无需事先进行复杂的核酸纯化和提取步骤,节省了时间和成本。5.**可扩增DNA和RNA**:BsuDNAPolymerase不仅可以扩增DNA,还可以直接扩增RNA,省去了额外的逆转录反应(cDNA合成)步骤,这对于RNA的检测和分析更加方便快捷。6.**无核酸外切酶和RNase残留**:BsuDNAPolymerase在生产过程中确保无核酸外切酶、切口酶及RNase残留,这有助于提高实验的准确性和重复性。Recombinant Human APRIL/TNFSF13 Trimer Protein,His-Flag TagProbe qPCR Mix (2×) 支持多重qPCR,即在单个反应中同时检测多个靶标基因 。
在DNA提取过程中避免RNA污染的关键在于采取一系列措施来确保RNA被有效去除或降解,同时保护DNA的完整性和纯度。以下是一些确保DNA提取过程中避免RNA污染的策略:1.**使用专门的DNA提取试剂盒**:选择高质量的DNA提取试剂盒,这些试剂盒通常已经包含了防止RNA污染的措施,如特定的裂解液和纯化步骤,能够有效去除RNA。2.**加入RNA酶(RNase)处理**:在DNA提取过程中加入RNase处理步骤,可以有效地去除残留的RNA污染。RNase是一种能够特异性降解RNA的酶,可以在不影响DNA完整性的前提下去除RNA污染。3.**优化实验操作步骤**:在破碎细胞时,选择合适的破碎方法和破碎时间,避免过度破碎导致RNA的释放;在DNA纯化阶段,控制好离心速度和时间,避免RNA的沉淀。4.**使用无RNase的试剂和耗材**:使用经过RNase-free处理的实验器材和试剂,确保实验过程中不会引入外源性RNA污染。5.**严格控制实验环境**:保持实验室台面和工作区域干净无尘,定期对实验室进行消杀,避免RNA酶污染。6.**个人防护和操作规范**:在处理DNA样品时,佩戴无菌手套和口罩,以减少呼吸道和皮肤污染的风险。使用不同的工具处理不同的样品,或者在处理前后彻底清洗工具,避免交叉污染。
CUT&RUN和ChIC是两种用于研究蛋白质-DNA相互作用的技术,它们有一些关键的区别:1.**技术原理**:-**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:ChIC技术利用抗体将感兴趣的蛋白与ProteinA-MNase相结合来进行DNA切割。ChIC的优势在于使用TF特异性抗体系住MNase,并只在结合位点裂解。-**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:CUT&RUN技术则是在核的轻微MNase处理后释放单核小体和TF-DNA复合物,留下寡核小体。CUT&RUN通过在冰上进行简短的消化反应,在TF结合的MNase扩散到周边的基因组和裂解可接近的染色质之前在上清中恢复TF-DNA复合物。2.**操作步骤和简便性**:-**ChIC**:ChIC可能需要甲醛固定操作,这可能重新引入了ChIP-seq的一些问题,如交联导致的DNA和蛋白质的化学修饰。-**CUT&RUN**:CUT&RUN简化了操作步骤,使用磁珠固定细胞核,适用于新鲜和冷冻组织样本,缩短了生成DNA测序文库的时间(1-2天)。3.**背景信号和信噪比**:-**ChIC**:ChIC产生的背景信号可能较高,因为它可能涉及到非特异性的DNA切割。
核酸内切酶VIII(EndonucleaseVIII)是一种来自大肠杆菌的DNA损伤修复酶,具有以下特点:1.**双功能活性**:核酸内切酶VIII具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。2.**释放受损嘧啶碱基**:N-糖基化酶活性可以释放双链DNA上受损的嘧啶碱基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,生成一个脱嘌呤(apurinic,AP)位点。3.**切割AP位点**:AP裂解酶活性可以切割AP位点的3'和5'端,产生一个具有3'和5'磷酸的碱基缺口(Gap)。4.**识别并切除受损碱基**:核酸内切酶VIII可以识别并切除多种受损碱基,包括尿素、5,6-二羟基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羟基-5-甲内酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羟基-5,6-二氢胸腺嘧啶和甲基羟丙二酰脲。5.**与EndonucleaseIII的区别**:虽然核酸内切酶VIII与核酸内切酶III相似,但核酸内切酶VIII具有β和δ裂解酶活性,而核酸内切酶III具有β裂解酶活性。6.**应用领域**:核酸内切酶VIII可以应用于单细胞凝胶电泳、NGS建库中DNA损伤修复、酶法合成DNA中释放DNA链、碱洗脱,搭配尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)进行含U片段的克隆等。
泛素连接酶E3识别特定的靶蛋白,并促进E2上的泛素转移到靶蛋白的赖氨酸残基上,形成靶蛋白-泛素复合物。Recombinant Mouse ENPP-1 Protein,His Tag
磁珠法DNA凝胶回收试剂盒是一种用于从DNA琼脂糖凝胶中回收特定DNA片段的实验室工具。与传统的柱纯化方法相比,磁珠法具有多个优势:1.**操作简便快捷**:磁珠法DNA凝胶回收试剂盒的操作步骤通常包括凝胶的融化、DNA的结合、磁珠的洗涤和DNA的洗脱,整个过程可以在20分钟内完成。2.**高纯度和高回收率**:磁珠法能够稳定、高效地从凝胶中回收DNA,纯化所得的DNA可直接用于酶切、连接、转化细菌、测序、PCR、杂交等后续操作。通常回收率达到60-80%,对于200bp以下小片段和10kb以上大片段的回收率有所下降。3.**适用性广**:适用于100bp以上DNA片段的纯化,对达到10kb片段DNA的纯化也能保持较好的效果。4.**安全性高**:操作过程中不涉及酚/氯仿等有毒试剂,更加环保和安全。5.**灵活性**:可以根据实际状况灵活调节磁珠用量,适应不同体积和浓度的样品处理。6.**自动化和高通量**:磁珠法纯化试剂盒适合手工操作,也可用于自动化工作站或核酸自动提取仪,实现高通量操作。Recombinant Mouse ENPP-1 Protein,His Tag
使用BloodGenomicDNAIsolationKitwithMagneticBeads(血液基因组DNA提取试剂盒,磁珠法)进行血液样本中基因组DNA的提取,主要步骤如下:1.**实验准备**:准备抗凝全血样本(如EDTA抗凝血),移液器及无菌,15ml离心管,无水乙醇,70%乙醇,干净的吸水纸,涡旋振荡器,金属浴/水浴,台式离心机等。2.**样本处理**:取适量血液样本,根据试剂盒要求,可能需要将血液体积调整至特定量,例如200μl,并可能需要加入PBS缓冲液。3.**裂解血液细胞**:向血液样本中加入蛋白酶K和细胞裂解液,涡旋混匀后,置于金属浴或水浴中进行裂解,通常在65°C孵育10...