DNA甲基化是研究 为普遍的表观遗传修饰，它被认为在许多生物学过程和疾病中有着重要的作用。随着测序技术的快速发展，二代测序与重亚硫酸盐处理基因组DNA相结合产生了可以在全基因组单碱基水平上测量DNA甲基化水平的全基因组重亚硫酸盐测序（whole-genome bisulfite sequencing...

DNA甲基化是研究 为普遍的表观遗传修饰，它被认为在许多生物学过程和疾病中有着重要的作用。随着测序技术的快速发展，二代测序与重亚硫酸盐处理基因组DNA相结合产生了可以在全基因组单碱基水平上测量DNA甲基化水平的全基因组重亚硫酸盐测序（whole-genome bisulfite sequencing...

DNA甲基化是一种重要的表观遗传学标记，在调控基因表达、细胞的分化与发育等过程中发挥着关键作用。使用基于重亚硫酸氢盐测序的方法进行DNA甲基化评估：首先用亚硫酸氢盐处理基因组DNA可将未甲基化胞嘧啶转化为尿嘧啶（黄色字母），而甲基化胞嘧啶保留为胞嘧啶（白色字母）；然后进行两轮PCR：first轮PC...

DNA甲基化是表观遗传学领域研究的重点之一。DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶（DNA methyltransferase, 缩写DNMT）的作用下，基因组DNA序列上CpG岛的二核苷酸5′端胞嘧啶转变为5′甲基胞嘧啶（5′ methylcytosine, 缩写5mC）。这种DNA修饰的方式并未改变...

全基因组重亚硫酸盐甲基化测序（WGBS）可以在全基因组范围内精确的检测所有单个胞嘧啶碱基（C碱基）的甲基化水平，是DNA甲基化研究的金标准。WGBS能为基因组DNA甲基化修饰的研究提供重要技术支持，能广泛应用在个体发育、衰老和cancer发生等生命过程的机制研究中。其原理是用 Bisulfite 处...

DNA甲基化是表观遗传调控的常见机制。启动子区域的高度甲基化可导致基因表达改变。甲基化多发生于胞嘧啶（cytosine, C）位置。在细胞和组织分化、疾病发生以及适应环境等过程中，甲基化状态可发生改变。高精确度全基因组甲基化修饰状态的分析，将为发育、育种、tumour标志物鉴定或药物靶标寻找等研究奠...

DNA甲基化是表观遗传修饰的主要方式，能在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表现。为外遗传编码（epigenetic code）的一部分，是一种外遗传机制。DNA甲基化过程会使甲基添加到DNA分子上，例如在胞嘧啶环的5'碳上：这种5'方向的DNA甲基化方式可见於所有脊椎动物。在人类细胞内，大约有1%...

目标区域甲基化重测序（Hi-Methylseq）结合了亚硫酸盐转换、靶向扩增子高通量测序技术，可实现多区段、多位点的甲基化精确定量分析，特别适合队列样本目标区域的甲基化分析，测序深度高，结果更加准确。适用于感兴趣目的片段甲基化研究；适用于在大样本中进一步确认全基因组甲基化研究挑选的阳性位点（DMR）...

在生物系统内，甲基化是经酶催化的，这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸(RNA)加工。重金属修饰可以在生物系统外发生。组织样本的化学甲基化也是组织染色的方法之一。表观遗传学的甲基化包括DNA甲基化或蛋白质甲基化。1）DNA甲基化。脊椎动物的DNA甲基化一般发生在Cp...

上海翼和生物甲基化测序采用的是重亚硫酸盐扩增子测序法（Bisulfite Amplicon Sequencing， BSAS），重亚硫酸盐转化是研究DNA甲基化的金标方法，该技术基于非甲基化胞嘧啶（C）向尿嘧啶（U）的化学转化，即用重亚硫酸盐处理基因组DNA，非甲基化胞嘧啶被转化为尿嘧啶，而甲基化胞...

SNP全称Single Nucleotide Polymorphism，即单核苷酸多态性，是指在基因组上单个核苷酸的变异，包括转换，颠换，插入和缺失，形成的遗传标记，其数量很多，多态性丰富，有些SNP位点直接影响基因功能，从而导致生物性状改变。SNP是研究人类家族和动植物品系遗传变异的重要依据，因此...

高通量二代测序法SNP基因分型——你有我有，你没有我也有：上海翼和应用生物技术有限公司通过自主研发的高重PCR技术，扩增引物经修饰及优化，克服了传统多重PCR扩增效率不均一问题，95%以上扩增子的测序深度在平均测序深度的0.2X范围，保证测序通量的有效利用。基于超高重PCR技术平台的高通量二代SNP...

两条高度相似的序列可能不存在同源性；同样的，同源序列的相似性也可能很低。例如两条同源序列的相似性比对结果不明显，但如果它们在结构上相似性上明显，或者它们都与第三条序列的相似性明显，那么它们显然是同源序列。因此，当相似性搜索发现统计学上显着的匹配时，我们可以放心地推断出这两个序列是同源的。但是，如果在...

序列相似性比较：将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较，用于确定该序列的生物属性，也就是找出与该序列相似的一致序列是什么。完成这一工作只需要使用两两序列比较算法。常用的程序包邮BLAST；FASTA等。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位，上海市****，至今已有十六年历史，...

SNP（单核苷酸多态性）是遗传学研究是不可缺少的一部分，上海翼和应用生物技术有限公司作为一家专门从事遗传学技术服务的公司，SNP基因分型也是日常项目中经常碰到的对象。但是目前成熟的SNP分型方法有很多，各有各的特点和适用性，这让很多刚开始接触SNP分型的人们难以选择，适合自己的分型方法。翼和生物可根...

SNP基因分型技术原理是PCR扩增含有SNP的基因组片段，主要特点是准确性高、灵活性强、通量大，主要方法是TaqMan探针法。首先通过PCR扩增含有SNP的基因组片段，然后通过序列特异性引物实现单碱基延伸，随后样品分析物与芯片基质共结晶后在真空管中受瞬时纳秒 (10-9s) 强激光激发。核酸分子因此...

为了获得更多糖原相关SNP位点，作者选择了包括Cg_GD1基因在内的5个基因，64个个体（32个高糖原个体和32个低糖原个体）进行重测序，，后得到732个高质量SNP。其中32个位于Cg_GD2基因，256个位于Cg_GS基因，用于后续的关联分析。结果显示有两个SNP与糖原含量有关。分别是位于Cg_...

旁系同源基因（paralogousgene）又译为“横向同源基因”、“并系同源基因”或“平行进化同源基因”，是指由于基因复制而产生的同源基因，例如人γ一珠蛋白基因和β一珠蛋白基因。基因复制后，进化选择压力变小，其中一条基因丢失或发生沉默，都能促使旁系同源基因分化，产生新特性或新功能的原因。然而，虽然...

理论上讲，SNP既可能是二等位多态性，也可能是3个或4个等位多态性，但实际上，后两者非常少见，几乎可以忽略。因此，通常所说的SNP都是二等位多态性的。这种变异可能是转换（C T，在其互补链上则为G A），也可能是颠换（C A，G T，C G，A T）。转换的发生率总是明显高于其它几种变异，具有转换型...

多倍体物种SNP分型的常用技术包括Sanger测序、SNP芯片、KASP等3种，这3种技术依赖于特异性的扩增或特异性的杂交，而多倍体物种亚基因组间高度同源，使得特异性扩增/杂交的难度**增加，这3种常用技术在无法保证特异性的前提下，得到的是混合结果，且无法对混合结果进行有效的拆分。这就导致多倍体物种...

在生物系统内，甲基化是经酶催化的，这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸(RNA)加工。重金属修饰可以在生物系统外发生。组织样本的化学甲基化也是组织染色的方法之一。表观遗传学的甲基化包括DNA甲基化或蛋白质甲基化。1）DNA甲基化。脊椎动物的DNA甲基化一般发生在Cp...

单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP），主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中，常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中比较常见存在，平均每500～1000个碱基对中就有1个，估计...

SNP全称Single Nucleotide Polymorphism，即单核苷酸多态性，是指在基因组上单个核苷酸的变异，包括转换，颠换，插入和缺失，形成的遗传标记，其数量很多，多态性丰富，有些SNP位点直接影响基因功能，从而导致生物性状改变。SNP是研究人类家族和动植物品系遗传变异的重要依据，因此...

将待检测片段（包含待测SNP位点）进行PCR扩增并直接进行测序是SNP检测方法中，准确的一种，堪称SNP分型的“金标准”。获得测序峰图，纯和位点为单峰，而杂合位点则为套峰，因此通过查看测序峰图很容易将基因型区分开来。直接测序法不仅可用于对已知位点的检测，还可用于发现未知的SNP位点。直接测序法的优点...

网络版本的NCBI在内的很多网站都提供了在线的blast服务，是**经常用到的blast服务。网络版本的NCBI优点：方便，容易操作，数据库同步更新等优点。网络版本的NCBI缺点：不利于操作大批量的数据，同时也不能定义搜索的数据库。单机版本的NCBI 通过NCBI的ftp站点获得。获得程序的同事...

BLAST是一个机遇序列相似性的数据库搜索程序。是“局部相似性基本查询工具”（BasicLocalAlignmentSearchTool）的缩写。Blast是一个序列相似性搜索的程序包，其中包含了很多**的程序，这些程序是根据查询对象和数据库的不同来定义的。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学...

RFLP法的优点是分型技术简单，结果判断容易，不需要昂贵的设备，成本低，并且实验人员培训简单。但是通过SNP能够导致RFLP的概率低，很多SNP位点不能采用这种方法进行检测，而且有的限制性酶价格昂贵并且不容易买到。通常酶切的条件较高，容易出现假阳性结果，且工作量大，耗时长，通量低。这是早期的一种SN...

SNP全称Single Nucleotide Polymorphism，即单核苷酸多态性，是指在基因组DNA序列中由于单个核苷酸（A，T，C和G）的突变引起的多态性。一个SNP表示基因组某个位点有一个核苷酸的变化，源于单个碱基的转换，颠换，插入和缺失。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事...

主要是指同源蛋白质的氨基酸序列或者碱基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和碱基序列。把几个相似的或相关的氨基酸或碱基的序列放到NCBI或者clustalw软件中进行对比，比对出其相似的程度。相似度越高，说明序列的同源性越高。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位，至今已有十六年历史，专...

物种的DNA甲基化率通常与物种基因组大小成正比。从细菌的数千个基因进化到高等动物的数万个基因，基因数增长的一个数量级。要管好这么多的基因，在漫长的一生中有规律地关闭或打开基因表达，DNA甲基化这个开关对高等动植物必不可少。转座子是一类在基因组上可以自主复制（或剪切）和移动的**功能元件。如果它们随意...