全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)用于全基因组DNA甲基化检测:表观遗传学研究已经证实了特定基因区域的DNA甲基化修饰对于染色体构象、基因表达调控机制有着重要影响,而全基因组DNA甲基化研究是表观基因组学关注的重要内容。Bisulfite处理能够将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U,进行PCR扩增后变成T,与原本具有甲基化修饰的C碱基区分开来,再结合高通量测序技术,可绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。重亚硫酸盐测序本质上就是重亚硫酸盐转化与二代测序(NGS)的结合。广州bisulfite甲基化重测序技术服务
DNA甲基化过程在一些生物学现象中起重要作用。例如,在原核生物中,它参与毒力、细胞周期调控、基因表达和对外源 DNA 导入的保护(DNA-宿主特异性)等过程。在高等真核生物中,DNA 甲基化参与调控染色体稳定性、印记、X 染色体失活和cancer 变等多个细胞过程。在哺乳动物中,DNA 甲基化主要发生在胞嘧啶碱基的第五个碳原子上,形成 5-甲基胞嘧啶或 5-甲基胞嘧啶核苷 (5-mC)。DNA甲基化几乎只存在于CpG二核苷酸上,是一个关键的表观遗传标记和基因表达调控因子。基因启动子或 CpG 岛处的甲基化 CpG 簇与基因失活有关。DNA 甲基化由一个被称为 DNA 甲基转移酶并包括 DNMT1、DNMT3a 和 DNMT3b 的酶家族催化。DNMT3a 和 DNMT3b是从头合成的甲基转移酶,能够甲基化之前未甲基化的 CpG二核苷酸。相反,DNMT1是一种维持性甲基转移酶,在复制过程中修饰半甲基化的 DNA。河南目标区段甲基化重测序准确度高重亚硫酸盐扩增子测序法基于非甲基化胞嘧啶(C)向尿嘧啶(U)的化学转化,即用重亚硫酸盐处理基因组DNA。
DNA甲基化是指针对DNA序列上的CpG岛,由甲基化转移酶将S腺苷甲硫氨酸的甲基转移给胞嘧啶。其中,5’甲基胞嘧啶(5mC) 的甲基化是一个非常重要的表观遗传学修饰事件,该事件能够调控基因活性,并影响着如细胞分化、转录调控和染色质重塑等生物学过程。重亚硫酸盐测序可以从单个碱基水平分析基因组中甲基化的胞嘧啶。首先,利用重烟硫酸盐对基因组DNA进行处理,将未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基变成尿嘧啶。而发生了甲基化的胞嘧啶未发生脱氨基,因而,可以基于此将经重亚硫酸盐处理的和未处理的测序样本进行比较来发现甲基化的位点。
DNA甲基化是DNA化学修饰的一种形式,能够在不改变DNA序列的前提下,改变遗传表现。DNA甲基化是指在甲基转移酶的催化下,DNA的CG两个核苷酸中的胞嘧啶被选择性地添加甲基基团的化学修饰现象,极常见的是在胞嘧啶的5号碳位置,在酶和底物的作用下,引入一个甲基基团,变成了5甲基胞嘧啶(5mC),从而改变了它的活性。DNA甲基化是基因组DNA的一种主要表观遗传修饰形式。DNA甲基化修饰对于维持正常细胞功能、传递基因组遗传印记、胚胎发育以及人类tumour发生,起着至关重要的作用。上海翼和生物通过亚硫酸氢盐(bisulfite)处理,用PCR扩增目的片段,并结合二代测序平台(illumina等主流测序平台)并对PCR产物进行测序,本方案目标区域甲基化测序服务Hi-MethylSeq,在完成目标区域检测的同时大幅降低研究费用。机体细胞在经历胁迫、创伤等环境变化后,会产生特定的应答,并往往会用DNA甲基化记录在DNA修饰中。
DNA甲基化是表观遗传学的重要内容。DNA甲基化是基因组DNA的一种主要表观遗传修饰形式。DNA甲基化修饰对于维持正常细胞功能、传递基因组遗传印记、胚胎发育以及人类tumour发生,起着至关重要的作用。甲基化研究成为表观遗传学的热点,相应的技术也是层出不穷,根据实验目的的不同,这些技术大体能够分成两类:全基因组甲基化检测技术以及特异性位点甲基化检测技术。翼和特色内容目标区域甲基化测序自主知识产权超高重PCR为基础,目标甲基化区段特异性捕获,更具针对性,经济型基于二代测序,可以获得目标区域内所有C的甲基化数据~500X的测序深度,精确计算每个位点C的甲基化程度通量高,可同时对成百上千个区域进行甲基化程度分析适用于大样本多区域的DNA甲基化水平检测Q30>80%检出率90%以上,90%以上测序片段测序深度>10X。目标区域甲基化重测序(Hi-MethylSeq),又叫重亚硫酸盐扩增子测序。天津目标区段甲基化重测序公司
DNA甲基化属于表观遗传的范畴。广州bisulfite甲基化重测序技术服务
WGBS能为基因组DNA甲基化时空特异性修饰的研究提供重要技术支持,能广泛应用在个体发育、衰老和疾病等生命过程的机制研究中,也是各物种甲基化图谱研究的优先方法。常规全基因组甲基化测序技术通过T4-DNA连接酶,在超声波打断基因组DNA段的两端连接接头序列,连接产物通过重亚硫酸盐处理将未甲基化修饰的胞嘧啶C转变为尿嘧啶U,进而通过接头序列介导的 PCR 技术将尿嘧啶U转变为胸腺嘧啶T。上海翼和是上海市遗传学会理事单位,上海市****,至今已有十六年的历史。广州bisulfite甲基化重测序技术服务
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