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Hi-SNP结合多重PCR技术和高通量测序技术,对需要检测的位点设计特异性引物,在单管内进行多重PCR扩增,不同的样本以不同的Barcode引物区分。混合样本后,在Ion Proton/Ion Torrent平台上,对扩增子进行高通量测序。测序结果使用生物信息学方法,区分不同的样本,,终获得每个...
片段长度多态性(限制性内切酶)法——RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)法的基本原理是通过PCR扩增目的片段DNA,扩增产物再用特异性内切酶酶切成不同大小的片段,直接通过凝胶电泳分辨基因型。不同等位基因的限制性酶切位点分布不同,产生不同长度的DNA*...
SNP指的是DNA序列上发生的单个核苷酸碱基之间的变异。SNP根据所处核酸位置不同,其预测的生物学功能不同,可以分为有***生物学意义和无***生物学意义的SNP。有生物学意义的SNP往往影响蛋白结构,表达,剪切等。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位,至今已有十六年历史,专注于为国...
二代测序法主要通过PCR的方法,对目标SNP位点进行特异性捕获。为了提**型的通量,目前多采用多重PCR的方法同时对多个位点进行捕获(可同时对1-100位点进行分型)。由于二代测序通量是足够满足数百数千样本的同时测序,因此需要对不同的样本添加***的样本标签(Barcode),从而在后续数据分析过程...
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中,常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中比较常见存在,平均每500~1000个碱基对中就有1个,估计...
DNA甲基化是指针对DNA序列上的CpG岛,由甲基化转移酶将S腺苷甲硫氨酸的甲基转移给胞嘧啶。其中,5’甲基胞嘧啶(5mC) 的甲基化是一个非常重要的表观遗传学修饰事件,该事件能够调控基因活性,并影响着如细胞分化、转录调控和染色质重塑等生物学过程。重亚硫酸盐测序可以从单个碱基水平分析基因组中甲基化的...
SNP全称Single Nucleotide Polymorphism,即单核苷酸多态性,是指在基因组DNA序列中由于单个核苷酸(A,T,C和G)的突变引起的多态性。一个SNP表示基因组某个位点有一个核苷酸的变化,源于单个碱基的转换,颠换,插入和缺失。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事...
目前市场上有多个厂家提供HRM分析的仪器,包括Idaho Technology、Corbett(QIAGEN)、Roche等,有些是**HRM的仪器,有些则是附带HRM功能的定量PCR仪。HRM的发明者—美国犹他大学医学院的Wittwer实验室曾评估了市场上多台仪器在基因分型和突变扫描上的性能1。他...
SNP全称Single Nucleotide Polymorphism,即单核苷酸多态性,是指在基因组DNA序列中由于单个核苷酸(A,T,C和G)的突变引起的多态性。一个SNP表示基因组某个位点有一个核苷酸的变化,源于单个碱基的转换,颠换,插入和缺失。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事...
DNA甲基化是表观遗传学领域研究的重点之一。DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase, 缩写DNMT)的作用下,基因组DNA序列上CpG岛的二核苷酸5′端胞嘧啶转变为5′甲基胞嘧啶(5′ methylcytosine, 缩写5mC)。这种DNA修饰的方式并未改变...
上海翼和生物基于自主知识产权的多重PCR捕获技术,结合特色的生信分析方法,开发了基于多重PCR的多倍体扩增子测序SNP分型,**提高了SNP分型的准确度。二代测序得到单分子序列信息,通过特色生信分析方法,对混合结果进行有效拆分,准确地将测序reads比对到亚基因组,拆分亚基因组同原序列,排除PSV和...
TaqMan荧光探针法优点是操作简单,准确性高(闭管进行,减少污染),判读也很方便,认可度高;适合多样本,少位点。但是其也有不可忽视的限制性,如探针合成耗时较长,价格昂贵,为了保证探针的稳定质量,一般大家会选择A公司合成。TaqMan荧光探针法一般为只有几个位点时适用,并且对样本的质量要求较高,除了...