多倍体物种SNP分型的常用技术包括Sanger测序、SNP芯片、KASP等3种，这3种技术依赖于特异性的扩增或特异性的杂交，而多倍体物种亚基因组间高度同源，使得特异性扩增/杂交的难度**增加，这3种常用技术在无法保证特异性的前提下，得到的是混合结果，且无法对混合结果进行有效的拆分。这就导致多倍体物种...

1. SNP数量多，分布比较常见。据估计，人类基因组中每1000个核苷酸就有一个SNP，人类30亿碱基***有300万以上的SNPs.SNP 遍布于整个人类基因组中，根据SNP在基因中的位置，可分为基因编码区SNPs（Coding-region SNPs，cSNPs）、基因周边SNPs（Perige...

单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP），主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中，常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中比较常见存在，平均每500～1000个碱基对中就有1个，估计...

二代测序法主要通过PCR的方法，对目标SNP位点进行特异性捕获。为了提**型的通量，目前多采用多重PCR的方法同时对多个位点进行捕获（可同时对1-100位点进行分型）。由于二代测序通量是足够满足数百数千样本的同时测序，因此需要对不同的样本添加***的样本标签（Barcode），从而在后续数据分析过程...

为了获得更多糖原相关SNP位点，作者选择了包括Cg_GD1基因在内的5个基因，64个个体（32个高糖原个体和32个低糖原个体）进行重测序，，后得到732个高质量SNP。其中32个位于Cg_GD2基因，256个位于Cg_GS基因，用于后续的关联分析。结果显示有两个SNP与糖原含量有关。分别是位于Cg_...

片段长度多态性（限制性内切酶）法——RFLP（RestrictionFragmentLengthPolymorphism）法的基本原理是通过PCR扩增目的片段DNA，扩增产物再用特异性内切酶酶切成不同大小的片段，直接通过凝胶电泳分辨基因型。不同等位基因的限制性酶切位点分布不同，产生不同长度的DNA*...

BLAST是一个机遇序列相似性的数据库搜索程序。是“局部相似性基本查询工具”（BasicLocalAlignmentSearchTool）的缩写。Blast是一个序列相似性搜索的程序包，其中包含了很多**的程序，这些程序是根据查询对象和数据库的不同来定义的。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学...

1. SNP数量多，分布比较常见。据估计，人类基因组中每1000个核苷酸就有一个SNP，人类30亿碱基***有300万以上的SNPs.SNP 遍布于整个人类基因组中，根据SNP在基因中的位置，可分为基因编码区SNPs（Coding-region SNPs，cSNPs）、基因周边SNPs（Perige...

SNP基因分型技术原理是PCR扩增含有SNP的基因组片段，主要特点是准确性高、灵活性强、通量大，主要方法是TaqMan探针法。首先通过PCR扩增含有SNP的基因组片段，然后通过序列特异性引物实现单碱基延伸，随后样品分析物与芯片基质共结晶后在真空管中受瞬时纳秒 (10-9s) 强激光激发。核酸分子因此...

BLAST是一个机遇序列相似性的数据库搜索程序。是“局部相似性基本查询工具”（BasicLocalAlignmentSearchTool）的缩写。Blast是一个序列相似性搜索的程序包，其中包含了很多**的程序，这些程序是根据查询对象和数据库的不同来定义的。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学...

DNA甲基化主要发生在启动子区CPG岛,在调节基因表达和其他功能方面起着关键作用.异常的DNA甲基化可参与调控疾病相关的分子信号通路,从而影响其正常功能。DNA甲基化在生物个体的生长发育与繁殖过程中，维持遗传物质的稳定性是至关重要的。细胞采用多种机制来保证DNA复制的忠实性，如DNA的双螺旋结构与半...

随着二代测序技术的普及，相比Sanger测序，二代测序虽然降低了测序读长，但是**增加的测序通量同时大幅降低测序成本。利用二代测序进行SNP分型，不仅测序读长满足分型需求，并且可以同时对数十数百个位点，上千样本进行分型。二代测序结果判断准确直观，相比RFLP，Taqman，LDR等方法都通过间接结果...