近年来，许多好气性发酵已发展到如此地步，以致氧的需求超过现有的发酵设备的氧传递的能力，其后果是氧传递率成为这种发酵生产的限制因素。愈来愈多的事实表明，氧的供应不足可能引起生产菌种的不可弥补的损失，或可能导致细胞代谢转向所不需的化台物的产生。由于菌体的新陈代谢与氧气呼吸有关，调节通风和搅拌，可影响发酵周期的长短和代谢产物生成的多少。而了解长菌阶段和代谢产物形成阶段的较合适需氧量，就可以分别合理地供氧，因此，溶解氧的控制是极其重要的。事实上，发酵液中氧的浓度并不需要达到饱和浓度，只要维持在氧的临界浓度以上即可。因此，应尽可能了解发酵过程中菌的临界氧浓度和达到比较高发酵产物的临界氧浓度，即菌的生长和发酵产物形成过程中的比较高需氧量，以便分别合理地供给足够氧气。通常搅拌可增加通气效果，且通气本身也具有搅拌作用，因此，发酵上常把通气和搅拌看作一个作业。生物发酵技术的应用已经逐步进入化妆品领域，它在保湿、美白、舒缓等功效方面均有较好的应用。中国台湾绿色发酵
在制药领域，通过微生物发酵生产的药物有氨基酸、核酸、酶及部分多肽等。根据不同的发酵菌种，可将微生物发酵制药分为好氧发酵、厌氧发酵和兼性厌氧发酵三类。根据使用的不同发酵工具，微生物发酵又可分为密闭发酵、敞口发酵、浅盘发酵及深层发酵等。其中深层发酵的技术门槛较高，需要专业的培养液，富含利于细菌发酵所需的营养物质和原料。深层发酵的优点是便于实现机械化操作及大规模发酵生产，青霉素的生产就曾借助于深层发酵技术。此外，合适的培养基也是取得良好转化产物的必要条件。人工培养基包括固体培养基、液体培养基、半固体培养基、脱水培养基这四种。江西天然发酵单价灵芝与当归共同发酵的产物灵归菌质，发酵时间越长，抑菌效果越好。
植物发酵是生物发酵的细分领域之一。长期以来，植物资源的开发局限于从现有植物中提取功效成分，而且通过传统萃取技术获得的天然植物成分存在弊端，其有效含量低，结构复杂甚至会产生毒副作用。但植物发酵技术对这些弊端提供了解决方案。通过微生物发酵富集营养物质的活性远大于传统萃取方法，同时，能有效降低成分的毒性，在提高安全有效指标评价方面是必不可少的一项技术。在当下市面上的不少明星产品中，我们都能看到植物发酵技术的运用。
发酵方式分为固态发酵与液态发酵，相比较来说，液态发酵操作更为复杂，产生的废水较多，但是可使产品品质更加稳定。
传统发酵食品制造和贮存过程工艺复杂，生产周期较长，影响因素多。传统发酵食品为混菌发酵体系，微生物群落具有高度的多样性和复杂性，发酵过程与风味和健康物质产生密切相关，难以准确追溯。
植物提取的功能性营养化学品对于人体健康具有重要意义，然而以往较高生产成本限制了市场的快速成长。随着合成生物学技术的发展，这些重要的植物天然提取物，已经可以采用发酵技术进行低成本生产。植物提取物广泛应用发酵技术，可以解决农副产品高值利用难题，提升现有中药和生物技术企业的技术水平。 生物发酵工程是生物工程的一个重要组成部分，微生物利用碳水化合物发酵生产各种工业溶剂和化工原料。
连续发酵是指以一定的速度一边将新鲜的培养基添加到发酵罐内，一边将含有产物的培养液放出的发酵方式连续发酵不盂要像分批发酵那样多次对发酵罐进行灭菌、清洗，能够缩短发酵周期，提高生产效率。目前，连续发酵已用来大规模生产乙醇、单细胞蛋白、食用酵母等，但连续发酵的工艺涉及变量较多、较难控制，因此连续发酵尚不如分批发酵应用较广。
在实际生产中，常常多种方式相结合来进行发酵生产。选择的依据包括菌种、产物和原料的特点、技术可行性、设备状况等。现代大规模发酵多数是好氧、液体、深层、分批、游离、单一纯种发酵结合进行。 好氧发酵：利用微生物在有氧气存在的情况下生成并积累微生物菌体或代谢产物。江西国产发酵哪里好
菌体浓度的大小对发酵产物得率会产生重要的影响。中国台湾绿色发酵
微生物发酵法是通过微生物的发酵生产目标产物的方法，具有工艺条件温和、生产安全、设备通用性高等特点，对某些食品营养强化剂，采用微生物发酵法具有产品效率高、单位能耗低、对环境的污染小等优势。作为营养素生产主流路径之一，微生物发酵法契合绿色、健康的趋势，发展前景广阔。微生物发酵法对技术要求较高，大致主要分为菌种选育、发酵培养、分离提取(破壁萃取)、纯化、精制、改性等关键步骤。其中菌种选育技术是产品提取的前提和基础，在产品提取过程中发挥了关键的作用；而发酵培养则是产品生产的关键环节,直接决定了产品的产量。中国台湾绿色发酵
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