发酵工程技术历史悠长，16世纪开始，传统食品进入天然发酵阶段。发酵工程技术经过了天然发酵、纯种发酵、好氧发酵，目前已进入现代发酵工程阶段，新一代发酵工程技术结合了合成生物学技术，高通量筛选与传统发酵的流程重构，发酵技术不断完善，逐渐实现智能化发展。
研发发酵产品需掌握以下三要素，生产菌种改造、发酵/酶转化过程优化与控制、产物分离提取纯化。
中药发酵是以微生物或酶为生物催化剂，对中药或中药提取物进行生物转化，使中药成为快速利用、定量疗效的新型药物。 厌氧发酵一般适用于微生物作用于有机化合物的分解代谢，反应时放出气体同时产生热量。甘肃天然发酵技术
生物发酵工程是生物工程的一个重要组成部分，微生物利用碳水化合物发酵生产各种工业溶剂和化工原料。乙醇、丁醇-异丙醇、2,3-丁二醇和甘油发酵是微生物进行溶剂发酵的几种形式。发酵一般泛指利用微生物制造工业原料或产品的过程。由微生物（细菌、酵母等）、有机物（主要是碳水化合物）、培养基等在一定的温度和pH等条件下进行。发酵技术指的是人们利用微生物的发酵作用，运用一些技术手段控制发酵的过程，从而进行大规模生产发酵产品的技术。发酵的概念来源于酿酒的过程，而发酵初来源于拉丁语的“发泡”。早在几千年前，我们祖先就已经开始使用发酵技术进行酿酒、调味品的调制，积累了丰富的发酵经验。初，发酵技术主要用于一些家庭作坊进行手工制作产品，产品的质量和数量都不尽如人意，后来，随着社会的不断发展和工业化的不断深入，实现了工业化的规模生产。发酵技术主要是通过使用微生物进行发酵，制作出独特风味的食品，包括酸奶、酒类以及调味品、腐乳腊肠、而在不同种类的食品发酵中，其原理和应用也是不尽相同。 陕西天然发酵生产企业菌种选育：按照生产要求，以微生物遗传变异理论为依据，采用人工方法使菌种变异，再筛选出符合要求的菌种。
从历史发展脉络看，生物发酵技术已经应用了很长时间。公元千 年前，古埃及人较早掌握了制作发酵面包的技术；古巴比伦人使用啤酒和酵母来帮助伤口愈合；古希腊妇女也常用酿酒发酵产生的泡沫来擦洗脸部和身体，以保持皮肤的健康美丽。中国早就有关发酵的护肤品，在马王堆汉墓中出土的"醪利中"有记载。简单来说，生物发酵护肤是指天然原物料与微生物通过发酵产生天然物质的护肤技术，发酵产物中含有多种类的营养元素，可不经稀释直接使用于面部，经第三方毒理学验证，对皮肤安全无刺激，同时可产生优异的护肤功效。
微生物发酵产物，顾名思义就是利用微生物发酵技术生成的人们需要的产物，在发酵的过程中会生成更加丰富的营养成分，同时发酵技术能将大分子转化成小分子，有效地提高皮肤吸收。很多微生物发酵产物已经应用到化妆品中，在《已使用化妆品原料目录》中也可以查询到。微生物发酵过程即微生物反应过程，是指由微生物在生长繁殖过程中所引起的生化反应过程。根据微生物的种类不同（好氧、厌氧、兼性厌氧），可以分为好氧性发酵和厌氧性发酵两大类。好氧性发酵在发酵过程中需要不断地通人一定量的无菌空气，如利用黑曲霉进行柠檬酸发酵、利用棒状杆菌进行谷氨酸发酵、利用黄单抱菌进行多糖发酵等等。厌氧性发酵在发酵时不需要供给空气，如乳酸杆菌引起的乳酸发酵、梭状芽抱杆菌引起的丁醇发酵等。兼性发酵酵母菌是兼性厌氧微生物，它在缺氧条件下进行厌气性发酵积累酒精，而在有氧即通气条件下则进行好氧性发酵，大量繁殖菌体细胞。 选择适当的基质和控制适当的浓度是提高代谢产物产量的重要方法。
在能源化工领域，乙醇作为一种生产工艺成熟、生产原料来源很广的清洁能源，不仅可以缓解能源短缺的问题，而且从能源长远利用度来看，也是一种潜力巨大的可再生能源。目前，酒精发酵的方式有间歇式、半连续式和连续式三种。除乙醇外，氢能源作为新能源主角，在世界能源舞台上引发高度关注。生物制氢包括光合生物制氢和厌氧发酵制氢两大类。研究表明，利用光合细菌进行生物制氢，具有多方面的优点，包括易培养、有较高的光能转化潜力、终产物纯度高等。利用异养型厌氧发酵细菌产氢，是大规模制氢的主要途径之一，具有速率高、无需光源、可日夜连续产氢、原料来源广、成本低廉等诸多优势。固体发酵：根据培养物的物理状态分类的一种发酵方式。发酵培养物为固态。天津生物发酵推荐
对于发酵控制来说，基质是生产菌代谢的物质基础，既涉及菌体的生长繁殖，又涉及代谢产物的形成。甘肃天然发酵技术
发酵后蛋白质和氨基酸含量有较大提高出现了蛋白质的“浓缩效应”；富含多种生物活性因子如营养小肽能赋予产品生理活性，如促生长、催乳、调节免疫、抗病毒、抗应激、抗氧化、刺激食欲、促进矿物质吸收等，代谢产物如蛋白酶、淀粉酶、纤维素酶等各种消化酶可促进饲料原料降解，提高动物消化率；代谢产物如益生菌和乳酸、异黄酮，一方面抑制肠道中有害菌繁殖，另一方面促进动物消化吸收，改善动物尤其是小动物的小肠机能，激发生长潜能；适口性改善提高采食量；安全无污染。甘肃天然发酵技术
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